Kaplica została zbudowana w drugiej połowie XV wieku razem ze szpitalem św. Gertrudy. Wokół kaplicy znajdował się cmentarz. W XVI wieku budynek przejęła gmina luterańska. W latach 1775-76, 1853-58 i 1912 była odnawiana. Od początku XX wieku do 1945 roku pełniła funkcje kaplicy przedpogrzebowej. W 1933 roku wystawiono w niej trumny z ciałami litewskich lotników Dariusa i Girenasa, którzy zginęli w katastrofie w Pszczelniku. Po II wojnie światowej wyposażenie kaplicy zostało zrabowane. Od 1969 roku pełniła funkcje wystawiennicze, a od 1977 roku jest siedzibą pracowni plastycznej, obecnie jest to Ośrodek Edukacji Plastycznej
Kaplica jest jednonawową gotycką budowlą orientowaną. W dolnych partiach jako budulca użyto kamienia, a w górnych cegły. Na szczególną uwagę zasługuje ostrołukowy portal z profilowanym zygzakowatym wałkiem w ścianie zachodniej kaplicy. Jest to bardzo rzadko spotykany na Pomorzu Zachodnim element architektoniczny. Oprócz Myśliborza takie portale możemy zobaczyć jeszcze w Kolegiacie Mariackiej w Stargardzie oraz Ratuszu w Chojnie. Z innych elementów warto zwrócić uwagę na sklepienie krzyżowo-żebrowe, które zostało oparte na wspornikach ozdobionych motywami geometrycznymi i maszkaronami. Na jednym ze wsporników zachował się gmerk, będący podpisem budowniczego. Kaplicę przykrywa ceramiczny dwuspadowy dach.